nf-core/rnaseq

采用STAR、RSEM、HISAT2或Salmon的RNA测序分析流程，提供基因/异构体计数及全面的质控分析。

nf-core/sarek

用于检测全基因组测序或靶向测序中胚系或体细胞变异的分析流程（包含预处理、变异调用和注释）

nf-core/modules

用于托管Nextflow DSL2社区工具特定模块文件的代码库！

nextflow-io/patterns

A curated collection of Nextflow implementation patterns

nf-core/mag

宏基因组的组装与分箱

nf-core/chipseq

ChIP-seq peak-calling, QC and differential analysis pipeline.